Grâce à des spécialités mises « en barrette » les élèves n’ont quasi pas  heure de permanence engendrée par la mise en place de la réforme. De plus 40 parcours différents de spécialités sont possibles pour les élèves.

10 spécialités sont proposées aux lycéens à l’Institut Notre Dame :
- Arts PLASTIQUES (ARTS)

- Histoire Géographie, Géo-politique & Sciences Politiques (H.G.G.S.P.)

- Humanités Littérature et Philosophie (H.L.P.)

- Anglais Monde contemporain (A.M.C.)

- Mathématiques (MATHS)
- Numérique et Sciences de l’Informatique) (N.S.I.)

- SCIENCES ECONOMIQUES ET SOCIALES (S.E.S.)

- SCIENCES PHYSIQUES et CHIMIQUES (SC-PH)

- SCIENCES & VIE DE LA TERRE (S.V.T.)

- SCIENCES de l'INGENIEUR (SC-I.) en partenariat avec un autre établissement

Options facultatives proposées en lycée

- LCA Latin

- LCA grec

- Musique

Options facultatives proposées en terminales

- MATHEMATIQUES expertes
- MATHEMATIQUES complémentaires
- Droit et Grands Enjeux du Monde Contemporain

Toutes les semaines ont lieu des Devoirs Surveillés encadrés par des personnels de l'équipe IND, garants du sérieux de l'application des conditions type BAC